2001年5月31日，同济科技大厦（国康基地一期）开工建设。

        2002年6月24日，国家教育部和科技部印发《关于同意北京理工大学等单位启动建设国家大学科技园的通知》（国科发高字「2002」188号），同意同济大学科技园启动建设国家大学科技园。

        2002年9月30日，同济科技园国康基地创业公寓楼结构封顶，并开始销售。

        2002年11月28日，同济科技园国康基地科技大厦科技楼按计划提前完成结构封顶。

        2003年6月30日同济科技大厦公寓楼取得《入住许可证》，同年10月公寓楼顺利取得产权证。

        2004年1月14日，上海市劳动和社会保障局同意同济大学国家大学科技园试运作上海市“职业见习基地”，参与上海“职业见习计划”实施。

        2004年7月15日，为贯彻落实杨浦区政府“三区”融合、联动发展的战略思路，上海同济科技园有限公司与四平街道签订了《“三位一体”青年实训基地协议书》。

        2004年，上海同济杨浦科技创业发展有限公司顺利完成了国康路二期规划地块内上海苏艺窗帘绣品厂3号楼的收购及上服十二厂地块中标。通过多方论证和对市场前景的考虑，公司决定聘请国际知名的日本建筑设计大师安藤忠雄主持设计国康基地二期建筑主体，以提升二期工程项目的品质。

        2005年9月26日，上海同济科技园有限公司作为发起单位之一，参加了上海市新材料行业协会生物降解材料专业委员会成立大会。

        2005年11月5日、6日，上海同济科技园有限公司联手复旦大学国家大学科技园承办了“2005年全国国家大学科技园工作交流会”。科技部高新司耿战修司长、教育部科技司武贵龙副司长、复旦大学、同济大领导和杨浦区领导，还有各省科技厅的有关领导，全国48家国家级大学科技园的主任、副主任等参加了会议。会议就大学科技园的发展的问题，《国家大学科技园“十一五”发展规划纲要》、《大学科技园评估指标体系》等问题进行了深入探讨并达成了多项共识。

        2005年11月，国康路基地二期地块内原有建筑开始拆迁。

        2006年4月26日下午，上海同济科技园有限公司与上海科技投资股份有限公司达成合作协议，双方将建立投融资合作机制，在信息、新能源、节能技术、新材料、环保等科技创新领域展开深入广泛的合作。

        2006年7月17日，全国大学校长论坛在上海举行，教育部部长周济带领在沪出席“中外大学校长论坛”的中方大学校长一行60余人莅临同济科技园国康基地，研究同济周边产业发展对地域经济的促进作用。

        2006年10月26日，同济科技园国康路基地二期上海国际设计中心举行开工典礼。

        2006年，座落于同济科技园国康基地内同济科技大厦四楼的商务中心作为大学科技园区小企业孵化起步平台，经营逐步呈现稳步发展的状态，这对完善园区功能，树立园区形象有着重要意义。

        2007年，上海同济科技园有限公司在科技园孵化基地内设立了大学生创业园，以配合大学生创业基金同济分基金会的工作。5月，上海同济科技园孵化器有限公司受上海市大学生科技创业基金同济分基金委托，对园内大学生创业项目进行投资并提供一系列孵化服务。

        2008年12月27日，同济科技园邯郸路基地同济逸仙大厦项目开工建设。

        2009年9月13日，上海同济科技园有限公司成功举办“2009上海设计产业发展论坛”，来自国家科学技术部、住房和城乡建设部、杨浦区人民政府、国内外知名设计企业、房地产企业等政府领导、专家学者及企业家，以“上海创意设计产业如何变‘中国制造’为‘中国设计’”为主题展开研讨，为推动“设计产业”的发展出谋划策。

        2009年9月，国康基地二期上海国际设计中心结构升顶。同济科技园邯郸路基地同济逸仙大厦项目于2010年3月10日开始地上工程施工，11月12日钢结构封顶，12月初土建工程顺利封顶。

        2010年，9月17日，同济科技园国康基地二期上海国际设计中心举办竣工交付入驻仪式。

        2012年5月4日下午，由同济大学科技园、设计公共服务平台、杨浦区科学技术委员会、上海优邑网络科技有限公司等单位共同举办的首届“环同济青年设计师展”在上海国际设计中心—同济设计展览馆盛大开幕，本次展览是环同济区域内青年设计师的集中创意交流，也是首次面向公众集体亮相。

        2012年5月6日上午，同济（常熟）科技园开工典礼仪式隆重举行。同济（常熟）科技园由同济科技园有限公司与常熟国家大学科技园有限公司共同出资建设，未来将建设成为同济大学科技成果转化基地和科技创新人才教育培训基地，并为常熟市的区域经济发展和产业升级提供新的动力。

        2012年5月17日上午， “同济大学技术转移中心”正式挂牌成立。该中心由上海同济技术转移服务有限公司负责运营，该公司由上海同济科技园和上海同济资产经营有限公司联合出资设立，是同济大学国家大学科技园的重要组成部分，是一个面向园区、面向社会的开放性服务平台。

        2013年4月，同济科技园举办第三届“环同济现代设计产业企业家沙龙”活动，本活动旨在构筑园区设计产业共享平台，促进企业间交流，提升园区设计专业孵化器的品牌效应。

        2013年5月，环同济设计产业公共服务平台—柔性设计馆展厅正式揭幕，同时，由科技园主办的第二届“环同济青年设计师展”在上海国际设计中心开幕，本届活动以“杨浦美化活动”主题，旨在通过公共平台促生更多优秀的设计作品和创新合作模式，创造大量的创意产值，进而推动杨浦区乃至上海的创意文化输出

        2013年7月常熟科技园项目结构封顶，比原计划提前了一个月，并与11月开始预售和招商。

        2014年7月17日，同济科技园（南通）项目公司顺利竞得南通市崇川区M14226地块的国有建设用地使用权。 该地块位于崇川开发区东区园林路东侧、世伦路西侧、新胜路北侧、钟秀路南侧，总用地面积约334亩,一期用地97亩。土地用途为工业用地。