2003年7月21日，同济大学科技园开始接受国家科技部、教育部的评估。同年10月16日，国家科技部、教育部批准认定同济大学科技园为国家大学科技园。
2004年8月8日，上海同济科技园有限公司与上海市劳动和保障局签订《职业见习基地协议书》，并被正式授予上海市“职业见习基地”称号。
2005年12月，同济科技园被国家科技部认定为“国家高新技术创业服务中心”。
2009年4月，上海同济科技园有限公司配合同济大学及杨浦区申报并获得了国家火炬中心授予的环同济研发设计服务特色产业基地称号。
2009年5月，上海同济科技园孵化器有限公司荣获2008年度杨浦区科技招商服务工作先进集体二等奖。
2009年，上海同济科技园有限公司组织参加了杨浦区总工会举办的“聚焦重点项目、重大工程，加快推进杨浦知识创新区建设立功竞赛”，公司基地建设部获得了“优秀青年突击队”称号，财务总监王元芳获得了巾帼建功奖。
2010年3月，同济科技园被认定为科技部大学生科技创业见习基地试点单位。
2010年3月，上海同济科技园孵化器有限公司被上海市杨浦区精神文明建设委员会评选为2008-2009年度杨浦区文明窗口。
2010年4月，上海同济科技园孵化器有限公司荣获2009年度科技招商服务工作先进集体二等奖。
2010年5月，由上海市建设工程金属结构（市优质工程）“金钢奖”评审委员会评选结果揭晓，由上海同济科技园有限公司开发建设的上海国际设计中心项目，荣获2009年度“金钢奖”。
2010年8月31日，上海同济科技园有限公司在“杨浦区2010聚焦重大工程，保障世博会成功运行立功竞赛推荐大会”受到多项表彰，公司土建预算组青年突击队荣获“优秀青年突击队”称号、公司机电配套组荣获“工人先锋队”称号、“上海国际设计中心”项目部经理胡杨荣获“建设者先锋”称号、青年突击队队长张峰荣获“优秀青年突击队队员”称号。
2010年10月，上海同济科技园市孵化器有限公司荣获上海市科技孵化协会考评A级。
2010年11月，同济科技园被教育部、科技部联合认定为国家首批“高校学生科技创业实习基地”。
2010年11月，由上海同济科技园有限公司下属公司上海同文置业有限公司开发的科技园邯郸路基地同济逸仙大厦A楼项目参加了德国建筑部、Xella伊通公司和德国慕尼黑工业大学举办的关于建筑可持续性发展论证的评比，最终获得了由德国慕尼黑工业大学颁发的关于建筑可持续潜力证书(铜质)。
2010年12月，上海同文置业有限公司开发建设的“逸仙路25号地块项目地上A楼工程” 荣获本年度上海市建设工程金属结构（市优质高产）“金钢杯”金刚奖，2011年4月11日获中国建筑金属结构协会建筑钢结构委员会组织评选的“钢结构国家金奖”。
2011年1月，上海同济科技园孵化器有限公司被评为“2010年度杨浦区大学生实习基地达标单位”。
2011年2月，上海同济科技园孵化器有限公司荣获2010年度科技创新创业服务先进集体，孙鸿岩荣获2010年度孵化器及大学科技园火炬统计个人表扬。
2012年3月31日，科技部、教育部联合公布2011年度国家大学科技园绩效评价结果，同济大学国家大学科技园荣获“A类(优秀)国家大学科技园”，并成功跻身排名前十强，取得位列第9位的好成绩。
2012年4月，上海同济科技园有限公司被正式认定为上海市第二批科技企业加速器试点单位。
2012年5月25日，同济科技园荣获“创业苗圃”和“科技企业加速器”授牌。同济科技园完成了创业苗圃—孵化器—加速器—产业集群四个阶段的企业服务体系建设为培育高层次创新创业人才和战略性新兴产业的源头企业提供了良好的建设环境。
同济晶度项目荣获上海市“民防优质结构杯”荣誉称号。近日，由同济科技园下属上海同文置业有限公司开发建设的同济晶度项目地下车库民防工程获得2011年度上海市“民防优质结构杯”荣誉称号，该奖项由上海市“民防优质结构杯”评审委员会评审，2011年仅有7项工程获此殊荣。
8月17日，科技园孵化器公司荣获2012年上海科技创新创业服务月活动优秀组织奖。包括杨浦区科委在内的7家区县科委以及16家孵化器公司获奖。
9月5日，上海市促进中小企业发展协调办公室公布了《上海市中小企业公共服务机构拟确定名单公示（第一批）》，包括科技园孵化器公司在内的全市80家中小企业公共服务机构获认定，该名单根据企业属性和服务内容分为综合服务、信息服务、投融资服务、创业服务、人才和培训服务、技术创新和质量服务、管理咨询服务、市场开拓服务、法律服务9大类，我园孵化器荣获综合服务类第18位。
同济科技园杨浦孵化基地党总支荣膺“杨浦区创先争优先进基层党组织”佳誉。
我园孵化器连续三年蝉联上海市考评优秀称号。公司不断谋求在体制机制、专业孵化服务平台建设以及管理措施创新，深化服务内涵，孵化服务成效明显。
我园孵化器连续八年荣获区科技招商服务先进集体称号。上海市杨浦区科学技术委员会表彰了2011年度杨浦区科技招商工作表现优异的单位及个人，我园孵化器自2004年以来连续第8年度荣膺“2011年度上海市杨浦区科技招商服务工作先进集体”称号。
2012年11月，同济大学技术转移中心获批国家级示范机构称号。经国务院有关部门推荐和专家评审，确定同济大学技术转移中心为第四批国家技术转移示范机构。
2012年11月29日，同济科技园被认定为第五批上海市知识产权试点园区，全市目前共有14家知识产权试点园区、8家知识产权示范园区。
2013年3月22日，“2012年度上海科技创新创业服务年会暨2013年科技创新创业服务站第一次会议”举行。同济科技园孵化器公司荣获“2012年度上海市科技创新创业服务先进集体” 和“2012年度上海市科技创新创业信息工作优秀单位”。
2013年 5月28日，同济科技园被上海市经济信息化委员会认定为“2013年上海市中小企业服务机构”。
2013年5月，园区获批成为上海市科协系统职称申报受理点，可受理上海市人力资源和社会保障局认可的各类职称申报，服务范围包括新材料与能源专业、计算机与信息技术专业、生物与医药专业、光科技专业等，具体覆盖29项职称的中高级申报。
2013年12月， 日前，根据市政府沪府发〔2013〕86号文《上海市人民政府关于表彰上海市促进就业先进集体和先进个人的决定》，上海同济科技园孵化器有限公司喜获“上海市促进就业先进企业（组织）”称号。
2014年3月，上海市科技创业中心组织召开“2014年上海市科技创新创业服务站会议”，上海同济科技园孵化器有限公司及上海同普公司同时获得“2013年度上海市科技创新创业服务先进集体”，孵化器公司获得“2013年度上海市科技创新创业信息工作优秀单位”荣誉称号。
2014年8月，国家科技部公布2013年度国家级科技企业孵化器考核结果，同济科技园被评为A类国家科技企业孵化器。 同济科技园成立于2001年，2003年被科技部、教育部认定为国家级大学科技园，2005年被认定为国家级科技企业孵化器。2012年，被科技部、教育部联合认定为A类（优秀）国家大学科技园，目前仅有5家园区获得“双A”,这是科技园区在国内能够获得的最高级别的认可和肯定。
2014年12月，上海市科学技术委员会公布2013年度上海市科技企业孵化器孵化服务评估结果，同济科技园孵化器再度获得孵化器考评“优秀”称号，这是自2010年以来同济科技园孵化器连续五年蝉联此项殊荣。
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